મોલેક્યુલર બીમ એપિટાક્સી ઉચ્ચ શૂન્યાવકાશ અથવા અતિ ઉચ્ચ શૂન્યાવકાશ (1 x 10) માં હાથ ધરવામાં આવી હતી^-8પા) પર્યાવરણ. મોલેક્યુલર બીમ એપિટેક્સીનું સૌથી મહત્ત્વનું પાસું તેનો નીચો ડિપોઝિશન રેટ છે, જે સામાન્ય રીતે ફિલ્મને પ્રતિ કલાક 3000 એનએમ કરતાં ઓછા દરે એપિટેક્સિયલ વૃદ્ધિની મંજૂરી આપે છે. આવા નીચા ડિપોઝિશન રેટને અન્ય ડિપોઝિશન પદ્ધતિઓની જેમ સ્વચ્છતાના સમાન સ્તરને પ્રાપ્ત કરવા માટે પર્યાપ્ત ઊંચા વેક્યૂમની જરૂર છે.

ઉપર વર્ણવેલ અતિ-ઉચ્ચ શૂન્યાવકાશને પહોંચી વળવા માટે, MBE ઉપકરણ （નુડસેન સેલ）માં ઠંડકનું સ્તર હોય છે, અને ગ્રોથ ચેમ્બરના અલ્ટ્રા-હાઈ વેક્યુમ વાતાવરણને પ્રવાહી નાઈટ્રોજન પરિભ્રમણ પ્રણાલીનો ઉપયોગ કરીને જાળવવું આવશ્યક છે. પ્રવાહી નાઇટ્રોજન ઉપકરણના આંતરિક તાપમાનને 77 કેલ્વિન (−196 °C) સુધી ઠંડુ કરે છે. નીચા તાપમાનનું વાતાવરણ શૂન્યાવકાશમાં અશુદ્ધિઓની સામગ્રીને વધુ ઘટાડી શકે છે અને પાતળી ફિલ્મોના જમાવટ માટે વધુ સારી પરિસ્થિતિઓ પ્રદાન કરી શકે છે. તેથી, MBE સાધનો માટે -196 °C પ્રવાહી નાઇટ્રોજનનો સતત અને સ્થિર પુરવઠો પૂરો પાડવા માટે સમર્પિત લિક્વિડ નાઇટ્રોજન કૂલિંગ સર્ક્યુલેશન સિસ્ટમ જરૂરી છે.